La Estación Experimental Agropecuaria Santiago del Estero realiza sus actividades a través de grupos de trabajo multidisciplinarios y en acuerdos interinstitucionales con el gobierno provincial, las universidades, las municipalidades, ONGs, fundaciones y asociaciones de productores (quienes al mismo tiempo efectúan el control social del INTA), focalizando en los siguientes temas:

Generación de tecnología para la producción agropecuaria sostenible en el chaco árido y semiárido.

Inventario, monitoreo y planificación de uso de recursos naturales (suelo, agua y vegetación natural). Tecnología de riego.

Ganadería bovina y caprina en sistemas extensivos del chaco árido y semiárido.

Selección y producción de algodón para el NOA.

Selección y producción de cebolla y melón con regadío.